Согласно древнему пророчеству, затонувший город Атлантида начинает подниматься на поверхность. Злая королева Рептилла собирается воспользоваться этой возможностью и заполучить Атлантиду. На помощь приходит гигантская горилла Конг, возрожденная из ДНК первого Конга и ДНК своего человеческого брата Джейсона. Горилла и ее друзья должны спасти Атлантиду и ее жителей от Рептиллы.