Масару Даймон - ученик средних классов школы. Он называет себя лучшим бойцом в Японии. Главный персонаж во время одной из драк сталкивается с Агумоном, персонажем, который сбежал из секретной организации, которая занимается отловом дигимонов, представителей цифрового мира, которых многие считают весьма опасными. Масару решает защитить своего нового друга. Правда, пока главный персонаж не вступит в ОБЦН, ему не дадут покоя. Масару и Агумон вскоре окажутся замешаны в одном громком деле: на одно из зданий нападает сбежавший дигимон. Для Агумона это отличная возможность проявить себя с лучшей стороны.